Η Βιβλιοθήκη συμμετέχει σε αρκετά έργα ευρωπαϊκού ή ελληνικού χαρακτήρα τα οποία είτε αφορούν τη συνολική της δραστηριότητα είτε κάποια επιμέρους υπηρεσία της.

Στο πλαίσιο της δημοσιότητας του Επιχειρησιακού Προγράμματος  ΚτΠ, υλοποιείται δράση με στόχο την απονομή βραβείων σε τελικούς δικαιούχους που πληρούν κριτήρια αριστείας σε υλοποίηση χρηματοδοτούμενων προγραμμάτων. Εξετάστηκαν αποκλειστικά φορείς που εκτέλεσαν έργα στο πλαίσιο της πρόσκλησης 65. Σε αυτήν εντάσσεται η Ανέμη, η οποία αποκόμισε βραβείο 90.000 Ευρώ υπό τη μορφή ενός νέου χρηματοδοτούμενου έργου, προϊόν του οποίου ήταν ο ΑΝΤΑΙΟΣ.  

Η συμμετοχή της Βιβλιοθήκης στο ΕΠΕΑΕΚ ΙΙ, με το Πρόγραμμα «Οίστρος», σκοπό έχει την ενίσχυση και τον εμπλουτισμό της. Έμφαση δίνεται στην ενίσχυση των συλλογών, τον εκσυγχρονισμό της υλικοτεχνικής υποδομής, στην εκπαίδευση του προσωπικού, στη διεύρυνση των υπηρεσιών προς τους χρήστες και στην αναβάθμιση της Ψηφιακής Βιβλιοθήκης.

Η Βιβλιοθήκη στα πλαίσια της οριζόντιας δράσης των βιβλιοθηκών έχει αναλάβει μέσω της ομάδας Τεχνολογιών και Πληροφόρησης να δημιουργήσει ένα εργαλείο για την αναζήτηση και ανάκτηση βιβλιογραφικών πληροφοριών από τις βάσεις δεδομένων των ελληνικών ακαδημαϊκών βιβλιοθηκών.

Το 2003 η Βιβλιοθήκη στο πλαίσιο του Μέτρου 1.3 “Τεκμηρίωση, αξιοποίηση και ανάδειξη του Ελληνικού Πολιτισμού” της πρόσκλησης 65, η οποία εντάσσεται στο Επιχειρησιακού Προγράμματος “Κοινωνία της Πληροφορίας” ανέλαβε το έργο “Ψηφιακή Βιβλιοθήκη Νεοελληνικών Σπουδών” που σκοπό είχε τη δημιουργία ψηφιοποιημένου υλικού που σχετίζεται με το Νεότερο Ελληνισμό. Η ψηφιακή βιβλιοθήκη παρέχει στον ερευνητή βιβλιογραφικές πληροφορίες αλλά συγχρόνως και τη δυνατότητα να ξεφυλλίσει ηλεκτρονικά ένα σημαντικό αριθμό παλαιών και σπάνιων τεκμηρίων, καθώς και νεότερων εκδόσεων των οποίων οι συγγραφείς επέτρεψαν την ψηφιοποίηση και ελεύθερη διάθεση στο διαδίκτυο.

Η Βιβλιοθήκη είναι ενεργό μέλος του Συνδέσμου των Ελληνικών Ακαδημαϊκών Βιβλιοθηκών.

• E-ten-Mediation of rare books over the Internet (2003-2004)
• Συντήρηση - αποκατάσταση και τεκμηρίωση της Βιβλιοθήκης του Φιλεκπαιδευτικού Συλλόγου Αδριανουπόλης
• Συμμετοχή στο Β΄ ΚΠΣ του ΕΠΕΑΕΚ Ι (1997 - 1999 ),
• Δημιουργία 31 Σχολικών Βιβλιοθηκών στην περιφέρεια Κρήτης
• Συνεργασίες της Βιβλιοθήκης στο ευρύτερο Πλαίσιο της Περιφέρειας Κρήτης
• Προγράμματα αναδρομικής καταλογογράφησης άλλων Βιβλιοθηκών
• Συνεργασίες στα πλαίσια του προγράμματος ΠΤΟΛΕΜΑΙΟΣ ΙΙ