Η Βιβλιοθήκη του Π.Κ συμμετείχε στο 2ο Κ.Π.Σ (1/1/1997 - 31/12/1999) με ένα πρόγραμμα συνολικού προϋπολογισμού (ΕΚΤ και ΕΤΠΑ) 1.100.000.000 δραχμές. Στόχος του έργου ήταν η αναβάθμιση και ο εκσυγχρονισμός της Βιβλιοθήκης του Πανεπιστημίου Κρήτης ώστε να αναδειχθεί σε ένα δυναμικό εργαλείο για την έρευνα, την εκπαίδευση, τη διδασκαλία και την επιστημονική πληροφόρηση σύμφωνα με τα σημερινά δεδομένα των τεχνολογιών πληροφόρησης.

Η επίτευξη των στόχων μας πραγματοποιήθηκε μέσα από την προσεκτική ζεύξη παραδοσιακών και σύγχρονων μορφών πληροφόρησης και επικεντρώθηκε στις παρακάτω ενότητες :

• Θεσμοθέτηση της οργανωτικής δομής της Βιβλιοθήκης και αναβάθμιση του κανονισμού λειτουργίας της.
• Συνεχής επιμόρφωση του προσωπικού και των χρηστών της Βιβλιοθήκης.
• Αναβάθμιση της δικτυακής υποδομής και των συναφών εφαρμογών.
• Εκσυγχρονισμός του βασικού εργαλείου χρήσης της Βιβλιοθήκης (ΠΤΟΛΕΜΑΙΟΣ ΙΙ).
• Δημιουργία φορέα σφαιρικής παροχής υπηρεσιών (Ηλεκτρονικό Αναγνωστήριο).
• Αναβάθμιση συλλογών-υλικού των μονάδων της Βιβλιοθήκης του Π.Κ.
• Δημιουργία Ψηφιακής Βιβλιοθήκης για τη διαχείριση της γκρίζας βιβλιογραφίας.